El piloto de carreras aéreas y especialista en acrobacias Hikaru Ichijo y su "sempai" (mentor), el mayor Roy Fokker, intentan una atrevida misión de rescate cuando la isla Atalia del Sur es invadida y bombardeada por las fuerzas Zentradi. Hikaru tiene su primer encuentro con Lynn Minmay, una joven camarera, mientras los mechas Zentradi comienzan a asaltar la ciudad. Mientras tanto, el capitán Bruno J. Global, la teniente Misa Hayase, la operadora del puente Claudia LaSalle y la tripulación del Macross intentan lanzar la nave por primera vez.
